Tháng 7 năm 2011, Inui lần đầu tiên đến châu Âu thi đấu và anh gia nhập đội bóng thi đấu tại 2. Bundesliga là VfL Bochum.[1] Một năm sau đó, anh ký hợp đồng có thời hạn 3 năm với đội bóng mới thăng hạng Bundesliga là Eintracht Frankfurt sau khi có thành tích ghi 7 bàn/30 trận tại Bochum.[2]

SD Eibar

Tháng 8 năm 2015, Inui đến Tây Ban Nha để gia nhập Eibar, trở thành cầu thủ có giá chuyển nhượng cao nhất lịch sử câu lạc bộ là 300.000 € và cũng là cầu thủ Nhật Bản đầu tiên khoác áo Eibar.[3]

Ngày 21 tháng 5 năm 2017, Inui lập cú đúp giúp Eibar dẫn trước Barcelona 2-0 ngay tại Camp Nou nhưng chung cuộc đội bóng xứ Catalan đã lội ngược dòng thắng lại 4-2.[4] Cú đúp này giúp anh trở thành cầu thủ Nhật Bản đầu tiên ghi bàn vào lưới Barcelona.[5]

Real Betis

Ngày 1 tháng 6 năm 2018, sau khi hết hạn hợp đồng với Eibar, Inui đến Real Betis với bản hợp đồng có thời hạn ba năm.[6]

Alavés (cho mượn)

Sau nửa đầu mùa giải không được trọng dụng tại Betis với chỉ 8 lần ra sân tại La Liga, Inui đã được cho Deportivo Alavés mượn đến hết mùa bóng 2018-19 vào cuối tháng 1 năm 2019.[7] Ngày 23 tháng 2, anh đạt đến cột mốc 100 trận tại La Liga và trở thành cầu thủ Nhật Bản đầu tiên làm được điều đó.[8] Anh có bàn thắng đầu tiên cho Alavés vào ngày 2 tháng 3 ấn định chiến thắng 2-1 trước Villarreal. Với pha lập công này, Inui trở thành cầu thủ Nhật Bản đầu tiên ghi bàn cho hai đội bóng khác nhau tại La Liga.[9] Anh tiếp tục ghi bàn ngay trong trận đấu kế tiếp sau đó với Eibar cũng tại La Liga trong trận hòa 1-1.[10]

Trở lại Eibar

Ngày 24 tháng 7 năm 2019, Inui trở lại Eibar theo bản hợp đồng có thời hạn 3 năm với phí chuyển nhượng 2 triệu €.[11]